Родился 8 сентября 1986 года в городе Портиман, Португалия. Воспитанник академий клубов "Портимоненси" и лиссабонского "Спортинга".

Свой дебютный матч за первую команду "Спортинга" провел в 2005 году, а всего сыграл за команду более 250 поединков. Отметим, что одновременно с ним в составе лиссабонского гранда выступал и ныне уже экс-динамовец Мигел Велозу. В 2010 году не без скандала перешел в "Порту", после чего президент "Спортинга" назвал Жоау "гнилым яблоком", но сам Моутинью вряд ли жалеет о своем выборе, ведь в составе "Драконов" он трижды становился чемпионом Португалии.

Ныне португалец защищает цвета "Монако", куда перебрался летом 2013 года, когда французский клуб начал тратить огромные деньги на усиление своего состава.

Игрок национальной сборной Португалии, в составе которой провел 81 матч (4 забитых мяча).